Index

C

compute_silhouette_command() (in module scsilhouette.cli)

D

download_h5ad() (in module scsilhouette.download)

E

extract_binary_genes() (in module scsilhouette.nsforest)

G

get_filename_from_url() (in module scsilhouette.download)

L

load_binary_gene_list() (in module scsilhouette.nsforest)

load_nsforest_binary_genes() (in module scsilhouette.nsforest)

M

main() (in module scsilhouette.cli) map_gene_symbols_to_ensembl() (in module scsilhouette.utils) module scsilhouette scsilhouette.cli scsilhouette.compute scsilhouette.download scsilhouette.nsforest scsilhouette.utils scsilhouette.viz

N

nsforest_genes_command() (in module scsilhouette.cli)

P

plot_correlation_summary() (in module scsilhouette.viz) plot_distribution() (in module scsilhouette.viz)

plot_dotplot() (in module scsilhouette.viz) plot_silhouette_summary() (in module scsilhouette.viz)

R

run_silhouette() (in module scsilhouette.compute)

S

scsilhouette module scsilhouette.cli module scsilhouette.compute module scsilhouette.download module

scsilhouette.nsforest module scsilhouette.utils module scsilhouette.viz module

V

viz_correlation_command() (in module scsilhouette.cli) viz_distribution_command() (in module scsilhouette.cli)

viz_dotplot_command() (in module scsilhouette.cli) viz_summary_command() (in module scsilhouette.cli)