scsilhouette package

Submodules

• scsilhouette.cli module
  • compute_silhouette_command()
  • main()
  • nsforest_genes_command()
  • viz_correlation_command()
  • viz_distribution_command()
  • viz_dotplot_command()
  • viz_summary_command()
• scsilhouette.compute module
  • run_silhouette()
• scsilhouette.download module
  • download_h5ad()
  • get_filename_from_url()
• scsilhouette.nsforest module
  • extract_binary_genes()
  • load_binary_gene_list()
  • load_nsforest_binary_genes()
• scsilhouette.utils module
  • map_gene_symbols_to_ensembl()
• scsilhouette.viz module
  • plot_correlation_summary()
  • plot_distribution()
  • plot_dotplot()
  • plot_silhouette_summary()

Module contents