scsilhouette

• scsilhouette package
  • Submodules
    • scsilhouette.cli module
      • compute_summary_stats_command()
      • compute_silhouette_command()
      • viz_summary_command()
      • viz_2D_projection_command()
      • viz_distribution_command()
      • main()
    • scsilhouette.compute module
      • load_obo_ids()
      • load_obo_labels()
      • filter_by_age()
      • run_silhouette()
      • compute_summary_stats()
    • scsilhouette.download module
    • scsilhouette.inspect_h5ad_annotations module
      • inspect_h5ad()
    • scsilhouette.logging_config module
      • setup_logger()
    • scsilhouette.nsforest module
      • load_nsforest_binary_genes()
      • extract_binary_genes()
      • load_binary_gene_list()
    • scsilhouette.utils module
      • get_output_prefix()
      • map_gene_symbols_to_ensembl()
    • scsilhouette.viz module
      • plot_silhouette_summary()
      • plot_2D_projection()
      • plot_distribution()
  • Module contents